Jednostavan test stolice mogao bi pomoći u otkrivanju raka debelog crijeva i gušterače
Rak probavnog sustava te bilijarnog trakta i gušterače često je teško otkriti u ranoj fazi, što stvara potrebu za praktičnim, neinvazivnim pristupima ranom otkrivanju i procjeni rizika. Crijevni mikrobiom pokazao se kao potencijalni izvor biomarkera za rak, nudeći praktične mogućnosti za neinvazivno testiranje jer se promjene u mikrobiomu mogu procijeniti analizom uzoraka stolice.
Međutim, primjena testiranja mikrobioma temeljenog na sekvenciranju u rutinskoj kliničkoj praksi i dalje predstavlja izazov zbog visokih troškova, analitičke složenosti i potrebe za specijaliziranom analizom podataka. Ciljana kvantitativna PCR (qPCR) metoda mogla bi ponuditi jednostavniji način pretvaranja signala mikrobioma u pristupačan test.
U tom kontekstu, japanski znanstvenici procijenili su šest mikrobioloških biljega u stolici i razvili logističke modele specifične za pojedine bolesti: rak debelog crijeva (CRC) i rak gušterače (PC). Za model raka debelog crijeva odabrana su četiri biljega (afb, nan, fsr i 5ar), dok su za model raka gušterače odabrana tri (but, fsr i saa).
Znanstvenici su procijenili sposobnost modela da razlikuju uzorke oboljelih od kontrolnih uzoraka koristeći metodu unakrsne provjere "leave-one-out" (izostavljanje jednog uzorka). Model za rak debelog crijeva postigao je vrijednost površine ispod krivulje (AUC) od 0,824, dok je model za rak gušterače postigao AUC od 0,780. Kada su utvrđeni modeli primijenjeni na srodne kliničke skupine, model za rak debelog crijeva pokazao je AUC od 0,716 kod kolorektalnog adenoma. Model za rak gušterače postigao je AUC od 0,804 u istraživačkoj podskupini s ranim stadijem raka gušterače te 0,540 pri razlikovanju osoba s visokim rizikom od raka gušterače (bez manifestne bolesti) od kontrolne skupine. U daljnjoj istraživačkoj usporedbi, fekalni qPCR rezultat pokazao je AUC od 0,739 za rani karcinom gušterače u odnosu na skupinu visokog rizika, u usporedbi s 0,543 za serumski CA19-9. Razlika nije dosegla konvencionalnu statističku značajnost.
Ovi rezultati sugeriraju da zajednički fekalni mikrobni panel može proizvesti različite specifične potpise za kolorektalni karcinom i karcinom gušterače. Rezultati također povećavaju mogućnost da bi fekalna qPCR mogla pružiti komplementarne informacije bez invazivnog uzorkovanja.